Os fluorcarbonos se decompõem quando diretamente expostos a altas temperaturas. Por exemplo, as chamas e os aquecedores de resistência elétrica provocarão a pirólise dos vapores dos fluorcarbonos. Os produtos dessa decomposição no ar incluem os halógenos, os ácidos halógenos (hidroclorídrico, hidrobrômico) e
outros compostos irritantes. Embora muito mais tóxicos do que o fluorcarbono que lhes deu origem, esses produtos da decomposição irritam o nariz, os olhos e as vias aéreas superiores, o que significa um aviso de sua presença.
O risco, na prática, é relativamente pequeno, pois é difícil que uma pessoa permaneça voluntariamente na presença de produtos de decomposição em concentrações que possam causar danos fisiológicos.
Quando são detectados esses produtos irritantes de fluorcarbonos, a área deve ser evacuada, ventilada e deve-se sanar a causa do problema.
Esses produtos de decomposição térmica podem, por exemplo, formar-se quando os vapores são atraídos por tabaco aceso. Portanto não é permitido fumar na presença dos vapores de fluorcarbonos.