I fluorocarburi si decompongono se esposti direttamente a temperature elevate. Ad esempio, fiamme e riscaldatori a resistenza elettrica causano la pirolisi dei vapori di fluorocarburi. I prodotti di questa decomposizione nell'aria comprendono alogeni, acidi alogeni (cloridrico, idrobromico) e
altri composti irritanti. Sebbene molto più tossici del fluorocarburo che li ha originati, questi prodotti di decomposizione irritano il naso, gli occhi e le vie aeree superiori, il che significa un avvertimento della loro presenza.
Il rischio, in pratica, è relativamente piccolo, poiché è difficile per una persona rimanere volontariamente in presenza di prodotti di decomposizione in concentrazioni che possono causare danni fisiologici.
Quando vengono rilevati questi prodotti irritanti al fluorocarburo, l'area deve essere evacuata, ventilata e la causa del problema deve essere risolta.
Tali prodotti di decomposizione termica possono, ad esempio, essere formati quando i vapori sono attratti dal tabacco acceso. Pertanto, non è consentito fumare in presenza di vapori di fluorocarburi.